TPO復合防水卷材施工不可避免的就是搭接、細部處理等問題，SBS卷材會通過同類型的瀝青、熱熔等去密封搭接處理，而TPO防水卷材只能通過薄層砂漿鋪貼來搭接，這就意味著兩層塑料膜之間夾著很薄的一層水泥砂漿。而在衛生間、管根處、用水泥砂漿濕貼很難操作，無法將全部界面用TPO防水卷材滿貼。

TPO復合防水卷材是被樹脂將增強網夾在中間，來提高其抗拉伸強度，也作為和砂漿層粘接的基礎，為了使得防水專用膠能充分浸潤TPO防水卷材而形成有效的粘接，不可能使得樹脂加厚，這就制約了TPO防水卷材的保護能力和拉伸強度的提升。